Ticket #14047: Portfile-ncbi_tools.diff

File Portfile-ncbi_tools.diff, 3.8 KB (added by mike012012@…, 17 years ago)
  • (a) Portfile-live vs. (b) Portfile

    a b  
    1 # $Id: Portfile 27165 2007-07-22 18:58:43Z ryandesign@macports.org $
     1# $Id: Portfile 20457 2006-11-03 15:12:00Z blair@macports.org $
    22PortSystem 1.0
    33name            ncbi_tools
    4 version         20061015
     4version         20070826
    55description     blast is a set of tools for doing nucleotide and protein searches
    66maintainers     michael.thon@yahoo.com
    77categories      science
     
    1010fetch.use_epsv  no
    1111master_sites    ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/toolbox/ncbi_tools/
    1212distfiles       ncbi.tar.gz
    13 checksums       md5 8eca84753fd7a1d39bab256a4944f65e
     13checksums       md5 c17f7b08c12823e4320661894110dcb1
    1414worksrcdir     
    15 use_configure   no
     15configure       {}
    1616build.cmd       './ncbi/make/makedis.csh'
    1717build.target
    18 set binaries   "Psequin asn2ff asn2gb asn2idx asn2xml asndhuff asntool bl2bag.cgi bl2seq blast blast.REAL blast_cs.REAL blastall blastcl3 blastclust blastpgp cdscan checksub copymat ddv debruijn demo_regexp demo_regexp_grep dosimple entrcmd entrez2 errhdr fa2htgs fastacmd findspl formatdb formatrpsdb getfeat getmesh getpub getseq gil2bin idfetch impala indexpub makemat makeset megablast ncbisort nph-viewgif.cgi psiblast.REAL psiblast_cs.REAL rpsblast seedtop seqtest tbl2asn test_regexp testcore testobj testval udv vecscreen wblast2.REAL wblast2_cs.REAL"
    19 
    20 set manpages    "Nentrez.1 Psequin.1 asn2asn.1 asn2ff.1 asn2gb.1 asn2xml.1 asndhuff.1 asntool.1 bl2seq.1 blast.1 blastall.1 blastcl3.1 blastclust.1 blastpgp.1 cdscan.1 checksub.1 copymat.1 ddv.1 debruijn.1 entrcmd.1 entrez2.1 errhdr.1 fa2htgs.1 fastacmd.1 findspl.1 fmerge.1 formatdb.1 gbseqget.1 getfeat.1 getmesh.1 getpub.1 gil2bin.1 idfetch.1 impala.1 indexpub.1 makemat.1 makeset.1 megablast.1 netentcf.1 rpsblast.1 seedtop.1 tbl2asn.1 udv.1 vecscreen.1"
     18set binaries   "Psequin          blastclust       findspl          psiblast.REAL \
     19asn2ff           blastpgp         formatdb         psiblast_cs.REAL \
     20asn2gb           cdscan           formatrpsdb      rpsblast \
     21asn2idx          checksub         gene2xml         sbtedit \
     22asn2xml          copymat          getmesh          seedtop \
     23asndhuff         ddv              getpub           seqtest \
     24asntool          debruijn         gil2bin          tbl2asn \
     25bl2bag.cgi       demo_regexp      idfetch          test_regexp \
     26bl2seq           demo_regexp_grep impala           testcore \
     27blast            dosimple         indexpub         testobj \
     28blast.REAL       entrcmd          makemat          testval \
     29blast_cs.REAL    entrez2          makeset          udv \
     30blastall         errhdr           megablast        vecscreen \
     31blastall_old     fa2htgs          ncbisort         wblast2.REAL \
     32blastcl3         fastacmd         nph-viewgif.cgi  wblast2_cs.REAL"
    2133
     34set manpages    " Nentrez.1       blastall_old.1  findspl.1       makeset.1 \
     35Psequin.1       blastcl3.1      fmerge.1        megablast.1 \
     36asn2all.1       blastclust.1    formatdb.1      netentcf.1 \
     37asn2asn.1       blastpgp.1      formatrpsdb.1   nps2gps.1 \
     38asn2ff.1        cdscan.1        gbseqget.1      rpsblast.1 \
     39asn2fsa.1       checksub.1      gene2xml.1      sbtedit.1 \
     40asn2gb.1        cleanasn.1      getfeat.1       seedtop.1 \
     41asn2idx.1       copymat.1       getmesh.1       sortbyquote.1 \
     42asn2xml.1       ddv.1           getpub.1        spidey.1 \
     43asndhuff.1      debruijn.1      gil2bin.1       tbl2asn.1 \
     44asntool.1       entrcmd.1       idfetch.1       trna2sap.1 \
     45asnval.1        entrez2.1       impala.1        trna2tbl.1 \
     46bl2seq.1        errhdr.1        indexpub.1      udv.1 \
     47blast.1         fa2htgs.1       insdseqget.1    vecscreen.1 \
     48blastall.1      fastacmd.1      makemat.1"
    2249
    2350destroot {
    2451        xinstall -d 755 ${destroot}${prefix}/share/doc/${name}
     
    3259}
    3360
    3461long_description        ${description}
     62livecheck.check         moddate
     63 No newline at end of file